Ученые научились предсказывать новые варианты SARS-CoV-2
Предупрежден — значит вооружен: появление новых штаммов можно прогнозировать за пять месяцев.
Модель, разработанная учеными из компании Vir Biotechnology и Института геномики и эволюционной медицины Университета Темпл (США), умеет предугадывать замену аминокислот в спайковом белке SARS-CoV-2. Этот белок позволяет вирусу проникать в клетку.
Модель позволяет с высокой точностью предсказать мутации, которые будут распространяться в ближайшие пять месяцев: по оценке ученых, только самых массовых вариантов вируса будет 22.
Ученые взяли за основу 48 параметров вируса и разделили их на пять групп: «вирусная эволюция», «иммунные характеристики», «заразность», «языковая модель мутаций» и «эпидемиологические особенности». Последний параметр очень важен, он отражает степень распространенности варианта.
При разработке модели ученые ретроспективно предсказали появление уже выявленных и распространенных мутаций коронавируса. Например, мутаций L452R, P618R, E484Q, которые привели к формированию дельта-варианта (индийского штамма). Вообще, пишут ученые, на конец апреля было выявлено более 6200 аминокислотных замен в спайковом белке, но все они являлись компонентами уже известных штаммов.
Даже если данных об изменениях в последовательностях аминокислот имеется мало, модель умеет прогнозировать появление мутаций. Ученые рассчитывают, что модель поможет медикам и властям корректировать курс противоэпидемических мер, создавать вакцины и улучшать методы выявления и лечения заболевания.