Ученые смогли визуализировать восстановление ДНК
Как только происходит повреждение ДНК, клетка активирует особый механизм — а белки быстро связывают поврежденную ДНК.
Исследователи разработали методику, которая позволила проанализировать процесс восстановления с ранее невиданной степенью детализации и точности — всё благодаря машинному обучению. Исследователи использовали высокопроизводительную микроскопию, которая позволяет получать тысячи снимков клеток после спровоцированного генетического повреждения.
Что сделали ученые? На первом этапе они ввели в клетки более 300 различных белков и в рамках одного эксперимента оценили, мешают ли они восстановлению ДНК со временем. ДНК повреждали ультрафиолетовым лазером. Результат оказался интересным — обнаружили девять новых белков, которые участвуют в восстановлении ДНК.
Многие белки прилипают к поврежденной ДНК, а другие наоборот, удаляются от повреждений, чтобы привлечь другие белки репарации. Значение имеет и то, и другое поведение — например, белок PHF20 перемещается от повреждений, чтобы способствовать привлечению белка 53BP1, критически важного для «починки» ДНК.
С помощью этой технологии возможно более эффективно и универсально работать с ДНК — в будущем это потенциально облегчит лечение раковых опухолей.
Результаты опубликованы в журнале Cell Reports.