Ученые разработали математический алгоритм TRACE, который реконструирует генеалогические связи прямо по ДНК живущих ныне людей. Это позволило точечно находить фрагменты, уходящие корнями глубоко в прошлое. Исследователи нашли «фантомную» линию, которая отделилась от общего древа около 800 тысяч лет назад, а ее смешение с Homo sapiens произошло еще до массового исхода людей из африканского континента. По этой причине фрагменты генома этой группы сегодня присутствуют абсолютно у каждого человека на Земле в объеме от 0,5% до 1%. Работа опубликована в журнале Science.
Ученые обнаружили в ДНК человека следы двух неизвестных архаичных гомининов
Ученые с помощью нового вычислительного метода TRACE обнаружили в геноме современных людей следы двух ранее неизвестных архаичных линий гомининов. Первая архаичная группа скрещивалась с людьми в Африке более 50 тысяч лет назад, а вторая, «суперархаичная», передала свою ДНК через денисовцев в Евразии. Открытие показывает, что скрытые эпизоды эволюции человека можно восстанавливать даже без анализа древних окаменелостей.
Древние гоминиды. Ninara / CC BY 2.0.
Как читать ДНК древних людей. До настоящего момента исследователям удалось полностью расшифровать лишь шесть качественных геномов древних гомининов — четыре неандертальских и два денисовских, причем все они были найдены исключительно на территории Евразии. В условиях дефицита окаменелостей, особенно в жарком климате Африки, где органика быстро разрушается, генетики научились использовать ДНК современных людей как «капсулу времени» для поиска утраченных видов.
Homo erectus. Предок Homo sapiens. Реконструкция.
Соавтор работы Юйлинь Чжан подчеркнула важность этого вывода: «Предыдущие публикации предполагали, что у современных людей может быть фантомное происхождение от неизвестных архаичных линий, но исследователи не могли сделать вывод, присутствует ли эта неизвестная примесь только у африканцев и когда именно произошло смешение. Нам же удалось найти и картографировать участки генома современных людей, полученные от этой фантомной линии, а также показать, что эта примесь есть у всех современных людей, а не только у жителей Африки».
Продолжение ниже
Видео
Продолжение
След древнейших гомининов и адаптация
Денисовцы. Реконструкция.
Другая выявленная линия оказалась еще более древней: ее возраст оценивается примерно в 1,8 миллиона лет. Эта популяция скрещивалась не напрямую с Homo sapiens, а с денисовцами. Когда денисовцы позже пересеклись с людьми современного типа, часть «суперархаичной» ДНК передалась и нашему виду. Наиболее ярко эти следы выражены у коренного населения Океании, отличающегося высоким уровнем денисовского наследия.
Суммарно обе найденные ветви формируют порядка 2% генома современного человека. При этом значительная часть выявленных фрагментов сосредоточена в генах, отвечающих за работу иммунитета и обмен веществ. Это свидетельствует о том, что полученный генетический материал помогал древним людям приспосабливаться к новым инфекциям, диете и условиям окружающей среды.
Загружаем